Prezentacja pre-Labu odbyła się 18 marca 2021 r. w ramach Seminarium POB Digiworld od godziny 14.00
Title: overview of the lab and interpretability of models applied to medicine
Abstract: What if a machine could discover a new physical matter or improve our understanding of disease? Due to rapid advances in artificial intelligence and hardware to collect data, such questions are no longer hypothetical. Our lab focuses on developing relevant generic artificial intelligence methods in two application areas: medicine and chemistry. These two domains are characterized by access to troves of data that have become challenging to analyze by humans. In the first part of the talk, we will give a short introduction to the field and describe the motivation behind our lab. In the second part of the talk, we will briefly discuss some of our recent application works in medicine, with a focus on interpretability.
Prelegenci:
Dr Stanisław Jastrzębski pracuje jako "Chief Scientific Officer" w Molecule.one oraz jest pracownikiem naukowym na Uniwersytecie Jagiellońskim. Pracę doktorską obronił na Uniwersytecie Jagiellońskim pod opieką Prof. Jacka Tabora i Prof. Amosa Storkey (University of Edinburgh). Pracował jako Postdoctoral Fellow na New York University. Aktywnie angażuje się w życie społeczności uczenia maszynowego jako organizator konferencji, członek MLinPL oraz area chair i recenzent. Wierzy, że w przyszłości metody sztucznej inteligencji będą aktywnie pomagały w odkryciach naukowych. W pracy naukowej stara się przybliżyć realizację tej wizji poprzez rozwijanie zastosowań w odkrywaniu leków oraz rozwijanie nowych metod trenowania sieci neuronowych.
Dr Bartosz Zieliński jest absolwentem Informatyki na Wydziale Matematyki i Informatyki UJ. Doktorat w naukach technicznych w dyscyplinie Informatyka obronił w 2012 roku w Instytucie Podstawowych Problemów Techniki PAN i od tego czasu jest zatrudniony na stanowisku adiunkta w Katedrze Informatyki Stosowanej UJ. Jest autorem i współautorem licznych artykułów w czasopismach z listy filadelfijskiej oraz publikacji na konferencjach NeurIPS, IJCAI i WACV. Obecnie jest członkiem zespołu InfoTech w projekcie FNP Team-Net, dotyczącym sztucznych sieci neuronowych inspirowanych biologicznie. Ponadto, pracuje jako Lead Data Scientist w firmie Ardigen S.A., gdzie wraz z zespołem wdraża modele głębokiego uczenia w problemach obrazowania biomedycznego.
Tytuł projektu: Innowacyjna diagnostyka mikrobiologiczna z zastosowaniem uczenia maszynowego
Kierownik: dr Bartosz Zieliński
Dyscypliny: biologia, informatyka techniczna
Okres realizacji: 10 miesięcy
Budżet: 50 000 PLN
Tytuł projektu: Interpretowalne sieci neuronowe w kontekście procesów poznawczych
Kierownik: mgr inż. Dawid Rymarczyk
Dyscypliny: informatyka, informatyka techniczna i telekomunikacja
Okres realizacji: 10 miesięcy
Budżet: 20 000 PLN
Tytuł projektu: Wyjaśnialność samo-nadzorujących się głębokich sieci neuronowych
Kierownik: inż. Michał Górszczak
Dyscypliny: informatyka
Okres realizacji: 5 miesięcy
Budżet: 15 000 PLN
Tytuł projektu: Dochodzenie epidemiologiczne z zastosowaniem samo-nadzorowanego uczenia maszynowego
Kierownik: mgr. Adriana Borowa
Dyscypliny: Informatyka
Okres realizacji: 10 miesięcy
Budżet: 20 000 PLN
Tytuł projektu: Mniej zachłanne uczenie się sieci neuronowych
Kierownik: Prof Jacek Tabor
Dyscypliny: informatyka, informatyka techniczna i telekomunikacja
Okres realizacji: 10 miesięcy
Budżet: 50 000 PLN
Tytuł projektu: Wykorzystanie interpolacji do lepszej generalizacji sieci neuronowych
Kierownik: Wiktor Daniec
Dyscypliny: informatyka
Okres realizacji: 10 miesięcy
Budżet: 15 000 PLN
Tytuł projektu: Grywalizacja procesu projektowania leków
Kierownik: mgr Tomasz Danel
Dyscypliny: informatyka, informatyka techniczna i telekomunikacja, nauki chemiczne, nauki farmaceutyczne
Okres realizacji: 10 miesięcy
Budżet: 20 000 PLN
Tytuł projektu: Stabilność reprezentacji ukrytej molekuł w autoenkoderach
Kierownik: dr hab. Igor Podolak
Dyscypliny: informatyka, nauki chemiczne, nauki farmaceutyczne
Okres realizacji: 12 miesięcy
Budżet: 49 880 PLN
Kontakt: bartosz.zielinski@uj.edu.pl